Linux環境中，安裝好mysql后，還不能直接啟動服務，必須先對數據庫進行初始化。初始化的工作主要包括：

• 初始化日志、表空間等數據庫必須的文件；
• 創建并初始化系統數據庫(mysql)。

初始化完成后，啟動mysqld守護進程，方可訪問數據庫。

在Windows的環境下，安裝包內已經自帶了一個初始化好的環境，安裝后展開在mysql根目錄的data子目錄。所以并不需要手工進行初始化。但是某些情況下，也可能需要從零開始初始化數據庫，比如：

• 數據文件被破壞，需要重建；
• 希望保留現有環境不動，建立一個新的環境；
• 希望建立一個干凈的環境。

不幸的是，Linux環境下是利用mysql_install_db.sh腳本初始化數據庫環境的；而在windows版中并沒有提供相應的腳本。那么該怎么辦呢？

經過對Linux環境下的mysql_install_db.sh的分析，發現初始化數據庫的命令主要是以下幾行：

其中：

• $create_system_tables、$fill_system_tables和$fill_help_tables分別是創建系統數據庫、初始化系統數據庫中的數據、和初始化幫助數據；
• $filter_cmd_line是過濾掉主機名（用于交叉初始化非本機運行數據庫環境的情況，可忽略）；
• $mysqld_install_cmd_line主要是"mysqld --bootstrap"命令；

分析清楚上述內容，就可以自己手工初始化數據庫了。具體步驟如下：

1. 設置mysql配置文件。主要是設置basedir（mysql的home目錄，如：/opt/mysql-5.1.40）和datadir（數據庫文件目錄，如：/var/db/mysql）兩個參數。
2. 初始化數據庫目錄，檢查/var/db/mysql和/var/db/mysql/mysql（系統數據庫）目錄是否存在，若不存在則手工創建之。
3. 準備初始化數據庫的sql腳本。將/opt/mysql-5.1.40/share目錄下的mysql_system_tables.sql、mysql_system_tables_data.sql和fill_help_tables.sql三個文件拷貝到/tmp目錄下，并在每個文件的最開始插入“use mysql;”一行。
4. 執行下列命令，初始化數據庫：
   • /opt/mysql-5.1.40/bin/mysqld.exe --bootstrap --console < /tmp/mysql_system_tables.sql
   • /opt/mysql-5.1.40/bin/mysqld.exe --bootstrap --console < /tmp/mysql_system_tables_data.sql
   • /opt/mysql-5.1.40/bin/mysqld.exe --bootstrap --console < /tmp/fill_help_tables.sql
5. 運行/opt/mysql-5.1.40/bin/mysqld.exe啟動數據庫服務（注意：停止數據庫服務的命令是/opt/mysql-5.1.40/bin/mysqladmin.exe -uroot shutdown）。
6. 運行/opt/mysql-5.1.40/bin/mysql.exe -uroot，訪問數據庫服務，驗證數據庫是否正常。

至此數據庫已初始化完畢，可以正常訪問了。